Gaussian'03

TR-Grid sitesinden

Örnek pbs: Gaussian03

Gaussian lisanslı bir programdır ve genellikle her kullanıcının kendi ev dizinine kurulmuştur. Bu nedenle kullanıcılar aşağıdaki betiği kullanırlarken, betiği kendi kurulumlarına ve ihtiyaçlarına göre değiştirmek durumundadırlar. Tüm kullanıcıların kullanımına açık bir Gaussian03 kurulumu mevcut değildir. Gaussian03 programı maksimum 4 çekirdek kullanabilmekdedir ve bu 4 çekirdeği sadece belli fonksiyonlar için kullanabilmektedir. Program genel olarak seri bir programdır.

#!/bin/sh
#
#PBS -q trgrida@ce.ulakbim.gov.tr
#PBS -N gaussian03
#PBS -l nodes=1:ppn=4
#
## Export all my environment variables to the job
#PBS -V
#
## Change to my working directory
cd $HOME

if [ "x$PBS_NODEFILE" != "x" ] ; then
  echo "PBS Nodefile: $PBS_NODEFILE"
  HOST_NODEFILE=$PBS_NODEFILE
fi

if [ "x$HOST_NODEFILE" = "x" ]; then
  echo "No hosts file defined.  Exiting..."
  exit
fi

CPU_NEEDED=`cat $HOST_NODEFILE | wc -l`

export g03root=$HOME/gaussian
export GAUSS_SCRDIR=/data/tmp
. $g03root/g03/bsd/g03.profile
export LD_LIBRARY_PATH=$g03root/g03:$LD_LIBRARY_PATH
GAUSS_LFLAGS="-kaon -kainterval 100 -nodefile '$HOST_NODEFILE'";export GAUSS_LFLAGS
PATH=$TMPDIR:$PATH; export PATH
 
$g03root/g03/bsd/g03l < input.com > out 2> err